林砚意外穿越到秦朝后，利用历史知识识破吕不韦的《吕氏春秋》暗藏的政治野心，巧妙借秦始皇之手打压吕不韦势力。随后，他又发现嫪毐与赵太后的奸情及谋反迹象，通过一系列布局，收集证据，最终协助秦始皇铲除嫪毐势力。在这过程中，他与秦始皇建立了亦师亦友的关系，同时结识了蒙恬等名将，逐步在秦朝站稳脚跟，为秦始皇出谋划策，推动统一进程。